As chuvas ácidas danificam seriamente os ecossistemas. Segundo o Fundo Mundial para a Natureza, 35% dos ecossistemas europeus já estão alterados e aproximadamente 50% das florestas da Alemanha e Holanda encontram-se já destruídas.
As consequências destas chuvas no ambiente afectam a Natureza, mas também o Homem.
Na Natureza as chuvas ácidas, ao entrar em contacto com as folhas das árvores, começa a corroê-las, destruindo-as e não permitindo às árvores fazer a fotossíntese. Se a chuva entrar em contacto com o solo, esta contamina-o e este torna-se ácido, matando as plantas que dele extraem os minerais. Num lago ou qualquer curso de água, os resultados da chuva podem ser desastrosos. A água do curso de água torna-se ácida, matando os peixes que nele vivem e dele retiram o oxigénio e qualquer outro ser vivo que dependa daquela água. Este problema tem-se vindo a agravar e a água da Costa do Atlântico Norte está entre 10 a 30% mais ácidas que há vinte anos atrás.
O Homem retira a água para consumo de rios, nascentes e lagos. Se estes estiverem contaminados, o ácido e qualquer produto tóxico que tenho saído da terra, devido a estas chuvas, afectará os Homens, causando sérios problemas de saúde. Outro prejuízo para o Homem é o facto de estas chuvas afectarem os monumentos, casas, prédios, e muitos outros edifícios, corroendo-os e danificando-os. Só na Europa há vários monumentos históricos a serem corroídos por estas chuvas. É o caso da Acrópole (Atenas), Coliseu (Roma), Notre Dame (Paris), Colônia (Alemanha).
O Homem deve tentar reduzir ao máximo a emissão de enxofre e azoto, para evitar estes prejuízos.